Recursos de Sofware e tutoriais

O headnode do sci-com roda a distribuição ROCKY LINUX, sem nenhum tipo de interface gráfica. Assim, a rigor qualquer código compatível com essa distribuição pode ser instalado individualmente na home do usuário desde que não exija qualquer tipo de recurso gráfico. 

A submissão de cálculos no sci-com utiliza o sistema de filas, através do software SLURM, e não é permitido a submissão de trabalhos fora do sistema de filas. Um breve tutorial do SLURM para uso no sci-com está disponível ao final desta página. Há no momento 5 filas configuradas, com as seguintes características fundamentais:

• ry-internet: os cálculos rodam em gavetas Ryzen 9 7950X 16-Cores 64GB geração z4, e podem estar ativos por até três dias;
   
• z3-long: os cálculos rodam em gavetas Threadripper 5975WX 32-Cores 256GB geração z3, e podem estar ativos por até 14 dias;
   
• z3-short : os cálculos rodam em gavetas Threadripper 5975WX 32-Cores 128GB geração z3, e podem estar ativos por até três dias;
   
• z1-short : os cálculos rodam nas workstations Threadripper 2990WX 32-Cores 128GB geração z1, e podem estar ativos por até três dias;
   
• ry-short: os cálculos rodam em gavetas Ryzen 9 7950X 16-Cores 64GB/128GB geração z4, e podem estar ativos por até três dias;
   
• ep-short: os cálculos rodam em gavetas Epyc 9754 128-Cores 768GB/1536GB geração z4, e podem estar ativos por até 14 dias;
   
• gpu-nv: os cálculos rodam em um workstation/placa gráfica Threadripper 3970X 32-Cores 128GB geração z2/Nvidea RTX A6000 48GB e Ryzen 9 5950X 16-cores 64GB geração z3/RTX 4070 Ti 16GB, e podem estar ativos por até 3 dias;

As filas possuem local scratch distintos, com capacidades entre 1.0TB e 8TB: para mais detalhes verificar o manual abaixo. É importante ressaltar que em nenhuma fila existe a possibilidade de paralelização entre os nós do cluster.

Há um conjunto de programas que já foram instalados e funcionam bem em várias das filas acima do sci-com. Não se espera portanto que novos usuários tenham qualquer dificuldade em instalá-los e utilizá-los nas suas homes. São eles:

• MOLPRO; 
   
• ORCA;
   
• NWCHEM;
   
• VASP;
   
• GAUSSIAN;
   
• QUANTUM EXPRESSO;
   
• CLASS;
   
• CAMB;
   
• COBAYA;
   
• GADGET;
   
• BILBY;
   
• TPOT;
   
• OPTUNA;

Há dois programas que já foram instalados e funcionam bem na fila gpu-nv, e não se espera portanto que novos usuários tenham qualquer dificuldade em instalá-los e utilizá-los nas suas homes. São eles:

• TPOT;
   
• OPTUNA;

O usuário deve estar atento para o fato de que é sua responsabilidade garantir possuir licença que permita o uso de qualquer software que instalar em sua home, inclusive aqueles listados acima.